의학 연구를 위한 R
의료 데이터 관리와 Shiny, Quarto를 활용한 시각화 리포트 제작
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더 나은 데이터 매니지먼트
보기 좋은 연구 결과
의료 데이터는 특수한 도메인의 데이터이기 때문에 환자의 개인정보를 보호해야 한다는 민감성과 가설 수립부터 임상 적용까지의 과정 사이에 제약이 발생할 수 있다는 특이성을 수반합니다. 따라서 이에 대한 이해가 충분한 연구자만이 의료 데이터를 다룰 수 있습니다. 하지만 실제 의학 관련 연구를 진행하는 병원 구성원이나 메디컬 및 바이오 헬스케어 기업 관련자들, 그리고 공공 의료 기관의 연구원들에게는 프로그래밍 자체가 어색할 수 있습니다. 따라서 의학 연구자에게 도움이 될 수 있도록 의료 데이터를 다룰 때 꼭 필요한 R 프로그래밍만을 깔끔하게 담았습니다.
이 책에서는 R을 사용한 의학 연구의 예시로 의학 연구와 R 사이의 관계를 정립하고, 곧바로 개인 PC 환경에서 어떻게 작업 환경을 구축하는지 알아봅니다. 그리고 연구 데이터를 다룰 때 필수적인 기본 통계와 데이터 기반 시각화를 R을 통해 학습한 후 분석과 통계에 유용한 R 패키지에 대해서도 하나씩 살펴봅니다. 또한, 특정 연구에 최적화된 패키지를 제작하는 방식과 이를 다른 필요한 연구자가 활용할 수 있도록 배포하는 과정을 거쳐봅니다. 마지막으로, 데이터 관리 및 프로그래밍에 직접 참여하지 않은 다른 연구자나 고객 또는 환자에게 보기 좋은 리포트를 공유할 수 있도록 돕는 Shiny와 Quarto에 대해 상세하게 학습해봅니다.
보기 좋은 연구 결과
의료 데이터는 특수한 도메인의 데이터이기 때문에 환자의 개인정보를 보호해야 한다는 민감성과 가설 수립부터 임상 적용까지의 과정 사이에 제약이 발생할 수 있다는 특이성을 수반합니다. 따라서 이에 대한 이해가 충분한 연구자만이 의료 데이터를 다룰 수 있습니다. 하지만 실제 의학 관련 연구를 진행하는 병원 구성원이나 메디컬 및 바이오 헬스케어 기업 관련자들, 그리고 공공 의료 기관의 연구원들에게는 프로그래밍 자체가 어색할 수 있습니다. 따라서 의학 연구자에게 도움이 될 수 있도록 의료 데이터를 다룰 때 꼭 필요한 R 프로그래밍만을 깔끔하게 담았습니다.
이 책에서는 R을 사용한 의학 연구의 예시로 의학 연구와 R 사이의 관계를 정립하고, 곧바로 개인 PC 환경에서 어떻게 작업 환경을 구축하는지 알아봅니다. 그리고 연구 데이터를 다룰 때 필수적인 기본 통계와 데이터 기반 시각화를 R을 통해 학습한 후 분석과 통계에 유용한 R 패키지에 대해서도 하나씩 살펴봅니다. 또한, 특정 연구에 최적화된 패키지를 제작하는 방식과 이를 다른 필요한 연구자가 활용할 수 있도록 배포하는 과정을 거쳐봅니다. 마지막으로, 데이터 관리 및 프로그래밍에 직접 참여하지 않은 다른 연구자나 고객 또는 환자에게 보기 좋은 리포트를 공유할 수 있도록 돕는 Shiny와 Quarto에 대해 상세하게 학습해봅니다.
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출판사 리뷰
출판사 리뷰
의료 데이터 관리와 Shiny, Quarto를 활용한 시각화 리포트 제작
문서와 스프레드시트만으로는 의미를 전달하기 어려운 연구 결과가 있지 않았나요? Shiny와 Quarto 기술을 습득하면 동적 시각화를 적극 활용한 리포트를 완성할 수 있습니다. 이 책과 함께 의료 데이터에 유용한 R 통계와 데이터 관리 및 분석 방식을 살펴보고, 완성된 코드를 다른 연구에도 활용할 수 있도록 패키지로 제작해 공유하는 방법까지 세세하게 알아봅시다. 마지막으로 Shiny와 Quarto를 통해 R 기반의 의료 데이터를 보기 좋은 연구 보고 자료로 정리해봅시다.
이 책의 특징
- 의학 연구에 대한 기본적인 의의와 작업 환경 설정부터 자세하게 설명합니다.
- 사례를 살펴보며 다중 선형 회귀, 로지스틱 회귀 등을 학습합니다.
- 바로 활용할 수 있는 기본 통계와 R 패키지 제작 및 공유 방식을 알아봅니다.
- 독자의 자가진단을 위한 장별 연습 문제를 제공합니다.
이 책이 필요한 독자
- R을 통한 데이터 관리 및 분석이 필요한 의학 관련 종사자
- 연구용 특수 데이터를 현장에서 어떻게 다루는지 알고 싶은 분
- 문서와 스프레드시트를 넘어 동적 시각화 리포트를 제작해보고 싶은 분
- 의료 데이터를 관리할 때 필요한 사고방식을 키우고 싶은 분
문서와 스프레드시트만으로는 의미를 전달하기 어려운 연구 결과가 있지 않았나요? Shiny와 Quarto 기술을 습득하면 동적 시각화를 적극 활용한 리포트를 완성할 수 있습니다. 이 책과 함께 의료 데이터에 유용한 R 통계와 데이터 관리 및 분석 방식을 살펴보고, 완성된 코드를 다른 연구에도 활용할 수 있도록 패키지로 제작해 공유하는 방법까지 세세하게 알아봅시다. 마지막으로 Shiny와 Quarto를 통해 R 기반의 의료 데이터를 보기 좋은 연구 보고 자료로 정리해봅시다.
이 책의 특징
- 의학 연구에 대한 기본적인 의의와 작업 환경 설정부터 자세하게 설명합니다.
- 사례를 살펴보며 다중 선형 회귀, 로지스틱 회귀 등을 학습합니다.
- 바로 활용할 수 있는 기본 통계와 R 패키지 제작 및 공유 방식을 알아봅니다.
- 독자의 자가진단을 위한 장별 연습 문제를 제공합니다.
이 책이 필요한 독자
- R을 통한 데이터 관리 및 분석이 필요한 의학 관련 종사자
- 연구용 특수 데이터를 현장에서 어떻게 다루는지 알고 싶은 분
- 문서와 스프레드시트를 넘어 동적 시각화 리포트를 제작해보고 싶은 분
- 의료 데이터를 관리할 때 필요한 사고방식을 키우고 싶은 분
목차
목차
1장 의학 연구에 대한 이해
_1.1 의학 연구란?
_1.2 의학 연구와 R
_1.3 R을 사용한 의학 연구의 예시
2장 작업 환경 설정
_2.1 포싯 클라우드 사용법
_2.2 R 데이터 매니지먼트
_2.3 연습 문제
3장 기본 통계 및 시각화
_3.1 R을 사용한 기본 통계
_3.2 R을 사용한 시각화
_3.3 연습 문제
4장 의료 데이터 분석 사례
_4.1 회귀 분석
_4.2 다중 선형 회귀
_4.3 로지스틱 회귀 분석
_4.4 tableone
_4.5 jsmodule
_4.6 data.table 활용 사례
_4.7 연습 문제
5장 R 패키지 제작 및 공유
_5.1 개요
_5.2 패키지 제작 시나리오
_5.3 R 패키지 제작
_5.4 R 패키지 배포
_5.5 R 패키지의 설치
_5.6 연습 문제
6장 Shiny
_6.1 개요
_6.2 작업 환경 설정
_6.3 첫 번째 Shiny 애플리케이션
_6.4 코드 구성
_6.5 코드 해석
_6.6 Shiny 애플리케이션 구축
_6.7 Shiny 애플리케이션 배포
_6.8 연습 문제
7장 Quarto
_7.1 개요
_7.2 작업 환경 설정
_7.3 마크다운
_7.4 문서
_7.5 게시
_7.6 아티클
_7.7 슬라이드
_7.8 연습 문제
8장 부록
_8.1 표본 코호트 DB
_8.2 다양한 형태의 데이터 처리
_8.3 시맨틱 버전
_8.4 포뮬러
_8.5 깃허브
_8.6 R에서의 에러 검진 방법
_8.7 DT의 주요 옵션
_8.8 reactable의 주요 옵션
_8.9 고급 Shiny 개발
_8.10 주요 레이텍 문법
_8.11 고급 시각화
_8.12 pkgdown
_8.13 R 추가 학습
_1.1 의학 연구란?
_1.2 의학 연구와 R
_1.3 R을 사용한 의학 연구의 예시
2장 작업 환경 설정
_2.1 포싯 클라우드 사용법
_2.2 R 데이터 매니지먼트
_2.3 연습 문제
3장 기본 통계 및 시각화
_3.1 R을 사용한 기본 통계
_3.2 R을 사용한 시각화
_3.3 연습 문제
4장 의료 데이터 분석 사례
_4.1 회귀 분석
_4.2 다중 선형 회귀
_4.3 로지스틱 회귀 분석
_4.4 tableone
_4.5 jsmodule
_4.6 data.table 활용 사례
_4.7 연습 문제
5장 R 패키지 제작 및 공유
_5.1 개요
_5.2 패키지 제작 시나리오
_5.3 R 패키지 제작
_5.4 R 패키지 배포
_5.5 R 패키지의 설치
_5.6 연습 문제
6장 Shiny
_6.1 개요
_6.2 작업 환경 설정
_6.3 첫 번째 Shiny 애플리케이션
_6.4 코드 구성
_6.5 코드 해석
_6.6 Shiny 애플리케이션 구축
_6.7 Shiny 애플리케이션 배포
_6.8 연습 문제
7장 Quarto
_7.1 개요
_7.2 작업 환경 설정
_7.3 마크다운
_7.4 문서
_7.5 게시
_7.6 아티클
_7.7 슬라이드
_7.8 연습 문제
8장 부록
_8.1 표본 코호트 DB
_8.2 다양한 형태의 데이터 처리
_8.3 시맨틱 버전
_8.4 포뮬러
_8.5 깃허브
_8.6 R에서의 에러 검진 방법
_8.7 DT의 주요 옵션
_8.8 reactable의 주요 옵션
_8.9 고급 Shiny 개발
_8.10 주요 레이텍 문법
_8.11 고급 시각화
_8.12 pkgdown
_8.13 R 추가 학습
저자
저자
김진환
생명과학과 컴퓨터과학에서의 데이터를 넘어 생명을 살리는 것에 R로 기여하는 개발자. 개발뿐 아니라 지식과 경험의 공유, 그리고 고양이를 좋아합니다.
- 깃허브 github.com/jhk0530
- 링크드인 linkedin.com/in/jinhwan-kim
- 미디엄 jhk0530.medium.com
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