감염역학 데이터 분석 입문
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우리 학자들이 번역한 감염역학 데이터 분석 입문서
보건의료는 감염병에서 점점 만성질환으로 중심이 옮겨가는 추세다. 하지만 코로나-19 유행에서 보고 겪었듯 감염병은 언제라도 큰 유행을 일으킬 수 있다. 사실 인간의 탐욕으로 인한 기후변화와 환경파괴로 오래된 질병이 재유행하거나, 전혀 새로운 질병이 출현해 대규모 유행을 일으킬 가능성은 점점 높아지고 있다.
저자인 니시우라 히로시 교수는 감염역학, 특히 모델링 분야에서 세계적인 대가로 손꼽힌다. 이 책은 저자가 코로나-19 대유행을 겪으면서 일본의 감염역학 기초 지식이 극히 낮고 감염병 역학자도 터무니없이 부족해 국가적 위기를 제대로 관리하지 못했다는 문제의식에서 후배 학자들과 함께 쓰고 엮은 감염역학 데이터 분석 입문서다.
그것이 일본만의 문제일까? 많은 전문가들이 경고하듯 장차 팬데믹이 훨씬 자주 찾아온다면 감염역학 지식과 인력을 확충하는 것은 우리에게도 시급한 문제일 것이다. 이를 위해 우리 학자 세 명이 의기투합해 번역한 이 책은 지금, 이곳의 급박한 필요에 대응하는 데 가장 기본적이면서도 강력한 무기가 될 것이다.
우리 학자들이 번역한 감염역학 데이터 분석 입문서
보건의료는 감염병에서 점점 만성질환으로 중심이 옮겨가는 추세다. 하지만 코로나-19 유행에서 보고 겪었듯 감염병은 언제라도 큰 유행을 일으킬 수 있다. 사실 인간의 탐욕으로 인한 기후변화와 환경파괴로 오래된 질병이 재유행하거나, 전혀 새로운 질병이 출현해 대규모 유행을 일으킬 가능성은 점점 높아지고 있다.
저자인 니시우라 히로시 교수는 감염역학, 특히 모델링 분야에서 세계적인 대가로 손꼽힌다. 이 책은 저자가 코로나-19 대유행을 겪으면서 일본의 감염역학 기초 지식이 극히 낮고 감염병 역학자도 터무니없이 부족해 국가적 위기를 제대로 관리하지 못했다는 문제의식에서 후배 학자들과 함께 쓰고 엮은 감염역학 데이터 분석 입문서다.
그것이 일본만의 문제일까? 많은 전문가들이 경고하듯 장차 팬데믹이 훨씬 자주 찾아온다면 감염역학 지식과 인력을 확충하는 것은 우리에게도 시급한 문제일 것이다. 이를 위해 우리 학자 세 명이 의기투합해 번역한 이 책은 지금, 이곳의 급박한 필요에 대응하는 데 가장 기본적이면서도 강력한 무기가 될 것이다.
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출판사 리뷰
출판사 리뷰
목차
목차
집필자 일람
머리말
1장 감염 및 감염병의 메커니즘과 역학적 지표
01 감염병 역학의 특징
02 감염병 역학의 기초
1. 감염과 감염병
2. 코흐의 가설
3. 역학 삼각
4. 비말 감염과 공기 감염
5. 감염병 퇴치ㆍ박멸을 위한 조건
6. 감염병의 중증도
03 기타 용어
1. 지표 사례
2. 1차/2차/3차 감염자
3. 감염병 발생 빈도
참고문헌
확인문제
2장 감염병의 자연사
01 소개
02 자연사 및 감염 감시 데이터 - 진단 편향의 문제
1. 불현성 감염 사례 검토
2. 불현성 감염과 치명적 위험
03 자연사의 시간 경과
04 잠복기의 유용성
1. 중증도 예측 인자로서의 잠복기
2. 감염병의 잠복기와 계절성의 관계
3. 단일 노출 유행 시 노출 시간 추정
4. 잠복기에 따른 감염 시점의 역계산
5. 검역 기간 결정
6. 검역 및 접촉자 추적을 통해 통제할 수 있는가?
05 요약
참고문헌
확인문제
3장 감염성 및 중증도 평가
01 감염성 평가
1. 2차 발병률
2. 기초감염재생산수(basic reproduction number, R0)
02 중증도 평가
참고문헌
확인문제
4장 집단 발병 조사 - 능동 감시
01 능동 감시
02 사례 정의
1. 사례 정의란?
2. 사례 정의의 평가
03 기술 역학 99
1. 시간, 장소, 사람
2. 유행 곡선 epi curve
3. 감염 양상별 유행 곡선
4. 유행 곡선을 그리는 방법
04 가설 검증
1. 환자대조군 연구
2. 인과관계 causation
참고문헌
확인문제
5장 감염자 비율의 추정
01 감염자 비율 분석
02 진단검사 데이터를 활용한 감염자 비율의 추산 방법
03 역계산법을 이용한 감염자 비율 추정 방법
1. 역계산의 기본 구조
2. 역계산법의 응용
3. HIV/AIDS 유행 통제의 어려움
4. 네트워크 구조와 감염병 역학
04 포획-재포획법을 이용한 감염자 비율 추산
1. 피터슨 방법
2. 역학 분야에서의 응용과 과제
05 혈청 역학 조사 활용
1. 누적 발생률
2. 중증도 추정
06 요약
참고문헌
확인문제
6장 예방접종 평가
01 감염과 면역
1. 감염성 질환의 종속 현상
2. 면역의 종류
3. 자연 감염에 의한 면역 지속성
4. 예방접종의 종류
02 예방접종의 집단 수준 평가
1. 상대적 위험도에 따른 평가
2. 기존 상식에서 벗어나자
03 예방접종에 대한 개인별 평가
1. 2차 감염 위험
2. 인플루엔자의 개인별 위험도
04 예방접종 정책 평가
05 요약
참고문헌
확인문제
7장 수동 감시와 관련 자료 분석
01 소개
02 감시의 정의
03 감시 관련 용어
1. 수동 감시와 능동 감시
2. 전수감시와 표본감시
3. 증후군 감시
4. 실험실 기반 감시
04 감시의 구성 요소
1. 수집
2. 대조
3. 분석과 해석
4. 보급과 활용
05 감시의 활용
1. 유행 규모 추정
2. 감염 분포 및 확산 현황 파악
3. 질병의 자연사 이해
4. 가설을 세우고 연구를 촉진
5. 집단 발병 발생 감지
6. 관리 및 예방 대책 평가
06 수동 감시의 문제점
1. 노력과 자원의 중복
2. 집단 발병 확인 및 보고의 지연
3. 지역으로 결과 전파와 피드백 부족
4. 훈련과 감시 실무 활동의 통합 부족
5. 프로그램 평가의 제한
6. 검사실 참여 부족
07 요약
참고문헌
확인문제
8장 집단 발병의 조기 감지
01 집단 발병 탐지의 개념
1. 임계치와 이상
02 집단 발병의 정량적 정의 문제
1. 집단 발병의 수학적 정의
2. 보고 지연의 조정
3. 체계적인 편차
4. 과거 이상 현상으로 인한 영향
5. 집단 발병 감지 시스템의 복잡성과 견고함
03 임계치 결정 방법
1. 회귀법
2. 시계열분석
3. 통계적 공정 제어 방법
4. 공간 정보 도입 방법
04 집단 발병 감지를 위한 감시의 실제
05 요약
참고문헌
확인문제
9장 감염병 수리모델 입문 소개
01 단기적인 감염병 유행의 특징
02 구획 모델
03 감염병 유행 발생 조건
04 유행 초기의 감염 확산 속도
05 집단 면역 임계치
06 유행의 최종 규모(누적 감염률 또는 유행 크기)
07 인구의 이질성
1 시각화를 통한 이해
2 행렬을 통한 이해
3 SIR 모델을 통한 이해
* 수리모델 보충설명
참고문헌
확인문제
10장 감염병 유행 모니터링
01 감염재생산수
1. 어느 세대 t에서 R
2. 2차 감염의 평가 지표로서 실질감염재생산수
02 실질감염재생산수의 종류와 추정
1. 순간감염재생산수
2. 코호트 감염재생산수
3. 두 가지 감염재생산수의 다른 사용법
03 실질감염재생산수의 통계적 추정 시 주의점
1. 보고 지연 조정
2. 감염일 함수로서 R(t) 추정
3. 적절한 세대기간의 필요성
4. 평균화 윈도우
5. 기타 데이터 관련 이슈
04 R 언어를 활용한 추정
1. 데이터 정보
2. 사용된 분포
3. 역계산의 실행
4. 지연 보정을 포함한 갱신 방정식
참고문헌
11장 2차 감염의 편차와 유행 발생 확률
01 2차 감염은 다양하다
1. 슈퍼전파
2. 슈퍼전파 현상에 따른 공중보건 대책 제시
02 대규모 유행 확률
1. 분기과정 모델
2. 해외 유입 감염자에 의한 대규모 유행 발생 가능성
3. 중국의 이동 제한으로 인한 일본의 유행 감소
03 유행 종식
1. 유행 종식의 판단
2. 진단 바이어스의 문제
04 요약
참고문헌
확인문제 해답
후일담: 코로나19 사태의 교훈과 다음 단계로 나아가기 위한 이정표
색인 ?
머리말
1장 감염 및 감염병의 메커니즘과 역학적 지표
01 감염병 역학의 특징
02 감염병 역학의 기초
1. 감염과 감염병
2. 코흐의 가설
3. 역학 삼각
4. 비말 감염과 공기 감염
5. 감염병 퇴치ㆍ박멸을 위한 조건
6. 감염병의 중증도
03 기타 용어
1. 지표 사례
2. 1차/2차/3차 감염자
3. 감염병 발생 빈도
참고문헌
확인문제
2장 감염병의 자연사
01 소개
02 자연사 및 감염 감시 데이터 - 진단 편향의 문제
1. 불현성 감염 사례 검토
2. 불현성 감염과 치명적 위험
03 자연사의 시간 경과
04 잠복기의 유용성
1. 중증도 예측 인자로서의 잠복기
2. 감염병의 잠복기와 계절성의 관계
3. 단일 노출 유행 시 노출 시간 추정
4. 잠복기에 따른 감염 시점의 역계산
5. 검역 기간 결정
6. 검역 및 접촉자 추적을 통해 통제할 수 있는가?
05 요약
참고문헌
확인문제
3장 감염성 및 중증도 평가
01 감염성 평가
1. 2차 발병률
2. 기초감염재생산수(basic reproduction number, R0)
02 중증도 평가
참고문헌
확인문제
4장 집단 발병 조사 - 능동 감시
01 능동 감시
02 사례 정의
1. 사례 정의란?
2. 사례 정의의 평가
03 기술 역학 99
1. 시간, 장소, 사람
2. 유행 곡선 epi curve
3. 감염 양상별 유행 곡선
4. 유행 곡선을 그리는 방법
04 가설 검증
1. 환자대조군 연구
2. 인과관계 causation
참고문헌
확인문제
5장 감염자 비율의 추정
01 감염자 비율 분석
02 진단검사 데이터를 활용한 감염자 비율의 추산 방법
03 역계산법을 이용한 감염자 비율 추정 방법
1. 역계산의 기본 구조
2. 역계산법의 응용
3. HIV/AIDS 유행 통제의 어려움
4. 네트워크 구조와 감염병 역학
04 포획-재포획법을 이용한 감염자 비율 추산
1. 피터슨 방법
2. 역학 분야에서의 응용과 과제
05 혈청 역학 조사 활용
1. 누적 발생률
2. 중증도 추정
06 요약
참고문헌
확인문제
6장 예방접종 평가
01 감염과 면역
1. 감염성 질환의 종속 현상
2. 면역의 종류
3. 자연 감염에 의한 면역 지속성
4. 예방접종의 종류
02 예방접종의 집단 수준 평가
1. 상대적 위험도에 따른 평가
2. 기존 상식에서 벗어나자
03 예방접종에 대한 개인별 평가
1. 2차 감염 위험
2. 인플루엔자의 개인별 위험도
04 예방접종 정책 평가
05 요약
참고문헌
확인문제
7장 수동 감시와 관련 자료 분석
01 소개
02 감시의 정의
03 감시 관련 용어
1. 수동 감시와 능동 감시
2. 전수감시와 표본감시
3. 증후군 감시
4. 실험실 기반 감시
04 감시의 구성 요소
1. 수집
2. 대조
3. 분석과 해석
4. 보급과 활용
05 감시의 활용
1. 유행 규모 추정
2. 감염 분포 및 확산 현황 파악
3. 질병의 자연사 이해
4. 가설을 세우고 연구를 촉진
5. 집단 발병 발생 감지
6. 관리 및 예방 대책 평가
06 수동 감시의 문제점
1. 노력과 자원의 중복
2. 집단 발병 확인 및 보고의 지연
3. 지역으로 결과 전파와 피드백 부족
4. 훈련과 감시 실무 활동의 통합 부족
5. 프로그램 평가의 제한
6. 검사실 참여 부족
07 요약
참고문헌
확인문제
8장 집단 발병의 조기 감지
01 집단 발병 탐지의 개념
1. 임계치와 이상
02 집단 발병의 정량적 정의 문제
1. 집단 발병의 수학적 정의
2. 보고 지연의 조정
3. 체계적인 편차
4. 과거 이상 현상으로 인한 영향
5. 집단 발병 감지 시스템의 복잡성과 견고함
03 임계치 결정 방법
1. 회귀법
2. 시계열분석
3. 통계적 공정 제어 방법
4. 공간 정보 도입 방법
04 집단 발병 감지를 위한 감시의 실제
05 요약
참고문헌
확인문제
9장 감염병 수리모델 입문 소개
01 단기적인 감염병 유행의 특징
02 구획 모델
03 감염병 유행 발생 조건
04 유행 초기의 감염 확산 속도
05 집단 면역 임계치
06 유행의 최종 규모(누적 감염률 또는 유행 크기)
07 인구의 이질성
1 시각화를 통한 이해
2 행렬을 통한 이해
3 SIR 모델을 통한 이해
* 수리모델 보충설명
참고문헌
확인문제
10장 감염병 유행 모니터링
01 감염재생산수
1. 어느 세대 t에서 R
2. 2차 감염의 평가 지표로서 실질감염재생산수
02 실질감염재생산수의 종류와 추정
1. 순간감염재생산수
2. 코호트 감염재생산수
3. 두 가지 감염재생산수의 다른 사용법
03 실질감염재생산수의 통계적 추정 시 주의점
1. 보고 지연 조정
2. 감염일 함수로서 R(t) 추정
3. 적절한 세대기간의 필요성
4. 평균화 윈도우
5. 기타 데이터 관련 이슈
04 R 언어를 활용한 추정
1. 데이터 정보
2. 사용된 분포
3. 역계산의 실행
4. 지연 보정을 포함한 갱신 방정식
참고문헌
11장 2차 감염의 편차와 유행 발생 확률
01 2차 감염은 다양하다
1. 슈퍼전파
2. 슈퍼전파 현상에 따른 공중보건 대책 제시
02 대규모 유행 확률
1. 분기과정 모델
2. 해외 유입 감염자에 의한 대규모 유행 발생 가능성
3. 중국의 이동 제한으로 인한 일본의 유행 감소
03 유행 종식
1. 유행 종식의 판단
2. 진단 바이어스의 문제
04 요약
참고문헌
확인문제 해답
후일담: 코로나19 사태의 교훈과 다음 단계로 나아가기 위한 이정표
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